一、普及率不高

虽然无痛胃镜检查在目前是一项比较好的检查，但由于在进行检查时需要对患者进行麻醉，而在目前麻醉科医生是最短缺的医院，进行手术的麻醉医生基本不够，有很多医生需要每天多次进行多台手术，所以医院一般没有专门配备做无痛胃镜的麻醉医生，在需要进行的时候要提前预约。

二、检查的时间长

由于无痛胃镜在检查的过程中需要麻醉，而在麻醉检查后又需要等患者清醒在进行心电监护，所以无痛胃镜所使用的时间会比普通胃镜所使用的时间长，有时候需要耗费一上午的时间，效率不高会让医生直接忽略这项检查。

三、需要预约

由于无痛胃镜需要麻醉医生，而医院的麻醉医生一般是短缺的，所以在进行无痛胃镜检查前需要预约。而医院的病人络绎不绝，想要做胃镜检查的人很多，所以预约胃镜检查的时间也就会更长一些，有些医院需要三四个月才能够进行，所以很多医生害怕耽误病情，只能让患者进行普通的胃镜。

四、价格比较高

因为在进行无痛胃镜检查时需要麻醉师进行麻醉，而且在醒来后需要进行心电监护以及吸氧等程序，而这些程序都需要产生费用，所以一次无痛胃镜检查的费用要比普通胃镜贵好几倍，所以在价格方面医生担心有些患者接受不了而建议进行普通胃镜。